普加乔夫领导的农民战争就这样失败了。失败的根源在于运动的自发性和分散性及其领导者缺乏明确的斗争纲领。普加乔夫及其拥护者是群众的君主专制思想意识的表达者，他们反对地主，但却拥护“好沙皇”。这是天真的君主主义思想的典型体现，形成这种思想的基础则是俄国农村的宗法制度。统治阶级和国家以正规军队、行政和警察机构、财政、教会和管理国家的历代经验来对付人民的自发性暴动。在这次农民战争中，被压迫的人民群众表现出非凡的英勇气概和果敢精神，从中涌现出许多杰出的组织者和卓有才干的军事指挥员。这次农民战争虽然失败了，但是在客观上对俄国的社会发展起了进步作用。普加乔夫领导的农民战争已作为沙俄时期人民群众为摆脱农奴制的压迫而进行英勇斗争的最突出的表现之一载入史册。1773～1775年的农民战争，无论在力量、团结、阶级划分、组织成分与觉悟程度方面，还是在社会口号的明确程度和阶级斗争的激烈程度方面，均超过以前的所有农民战争。人民虽然遭到失败，但却获得了进行革命斗争的经验。这次农民战争使人民对封建制度不可破除的信念产生了动摇，加速了地专制制度的崩溃。在普加乔夫领导的农民战争的影响下，18至19世纪的俄国农民阶级斗争又有了进一步的新发展。