广西叛乱平定后，孙中山决定出师北伐，但陈炯明想占据两广，反对北伐。同时，还勾结驻洛阳的吴佩孚、驻长沙的赵恒惕，对孙中山准备北伐的活动多次进行破坏，指使湖南督军赵恒惕拒绝北伐军过境。孙中山迫不得已，于1922年4月21日，免去陈炯明的内务总长、粤军总司令、广东省长三项职务。陈炯明不思反悔，继续操纵他的爪牙蓄谋叛变。
6月14日，不断有人到总统府报告陈炯明谋反的消息，但孙中山不相信陈炯明会真的背叛他。
6月16日深夜，坐落在广州观音山的越秀楼总统官邸，还像往常一样发出明亮的灯光。孙中山仍未入眠，他端坐在堆着厚厚卷宗的办公台前，时而伏案疾书，时而起身查看挂在墙上的北伐进军地图。
大约2点左右，孙中山刚刚躺下，寂静的夜空中，便隐隐约约传来一阵阵军号声，还夹杂着稀疏的枪炮声，陈炯明果然下手了。
侍卫们来到孙中山的卧室外，等候命令。这时候孙中山决然表示:“我断不能值此危难关头，离弃职守!”后来，经过大家反复苦求，孙中山才勉强答应与宋庆龄一块转移。但宋庆龄深明大义，她知道若和孙中山一起走，会带来许多麻烦，请求孙中山先走，自己只身留下。
枪炮声越来越近，子弹不时从总统府上空呼啸而过。孙中山还在犹豫不决，大家一时顾不得许多，便七手八脚为他乔装易服。秘书林直勉找来一块白布，裹住孙中山的公文包，便和另一位参军强扶孙中山迅速出了总统府。