广西叛乱平定后,孙中山决定出师北伐,但陈炯明想占据两广,反对北伐。同时,还勾结驻洛阳的吴佩孚、驻长沙的赵恒惕,对孙中山准备北伐的活动多次进行破坏,指使湖南督军赵恒惕拒绝北伐军过境。孙中山迫不得已,于1922年4月21日,免去陈炯明的内务总长、粤军总司令、广东省长三项职务。陈炯明不思反悔,继续操纵他的爪牙蓄谋叛变。
6月14日,不断有人到总统府报告陈炯明谋反的消息,但孙中山不相信陈炯明会真的背叛他。
6月16日深夜,坐落在广州观音山的越秀楼总统官邸,还像往常一样发出明亮的灯光。孙中山仍未入眠,他端坐在堆着厚厚卷宗的办公台前,时而伏案疾书,时而起身查看挂在墙上的北伐进军地图。
大约2点左右,孙中山刚刚躺下,寂静的夜空中,便隐隐约约传来一阵阵军号声,还夹杂着稀疏的枪炮声,陈炯明果然下手了。
侍卫们来到孙中山的卧室外,等候命令。这时候孙中山决然表示:“我断不能值此危难关头,离弃职守!”后来,经过大家反复苦求,孙中山才勉强答应与宋庆龄一块转移。但宋庆龄深明大义,她知道若和孙中山一起走,会带来许多麻烦,请求孙中山先走,自己只身留下。
枪炮声越来越近,子弹不时从总统府上空呼啸而过。孙中山还在犹豫不决,大家一时顾不得许多,便七手八脚为他乔装易服。秘书林直勉找来一块白布,裹住孙中山的公文包,便和另一位参军强扶孙中山迅速出了总统府。